Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAB5

H2bfm, H2B histone family, member M, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2bfmQ9DAB5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2bfmQ9DAB5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms