Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DA42 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DA42 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DA42 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DA42 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DA42 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DA42 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DA42 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DA42 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DA42 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DA42 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DA42 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms