Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmbim4Q9DA39 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmbim4Q9DA39 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms