Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tbc1d20Q9D9I4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tbc1d20Q9D9I4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms