Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9H8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9H8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms