Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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