Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms