Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms