Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rexo2Q9D8S4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms