Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Q9D8Q6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Q9D8Q6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9D8Q6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q9D8Q6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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