Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf3c6Q9D8P7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c6Q9D8P7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms