Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Q9D8L0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9D8L0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms