Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms