Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chmp4bQ9D8B3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Chmp4bQ9D8B3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chmp4bQ9D8B3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms