Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms