Protein–RNA interactions for Protein: Q9D809

2200002D01Rik, MCG22941, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002D01RikQ9D809 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
2200002D01RikQ9D809 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
2200002D01RikQ9D809 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms