Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sh2d4aQ9D7V1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d4aQ9D7V1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms