Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Cldn22Q9D7U6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Cldn22Q9D7U6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cldn22Q9D7U6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cldn22Q9D7U6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn22Q9D7U6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms