Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp5Q9D7S9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms