Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms