Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbe1Q9D6Y9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbe1Q9D6Y9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms