Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc94Q9D6J3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc94Q9D6J3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms