Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc9bQ9D6E4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms