Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rab11fip1Q9D620 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rab11fip1Q9D620 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab11fip1Q9D620 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Rab11fip1Q9D620 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab11fip1Q9D620 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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