Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc81Q9D5W4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc81Q9D5W4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms