Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer4f1Q9D5Q6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer4f1Q9D5Q6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms