Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Ubxn11Q9D572 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubxn11Q9D572 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms