Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam227bQ9D518 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam227bQ9D518 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms