Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubgcp4Q9D4F8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubgcp4Q9D4F8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms