Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam90a1bQ9D4F3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam90a1bQ9D4F3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms