Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Odf2lQ9D478 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Odf2lQ9D478 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Odf2lQ9D478 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Odf2lQ9D478 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2lQ9D478 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Odf2lQ9D478 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Odf2lQ9D478 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Odf2lQ9D478 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2lQ9D478 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Odf2lQ9D478 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Odf2lQ9D478 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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