Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OxsmQ9D404 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms