Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpn3Q9D3W4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms