Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph14Q9D3W1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph14Q9D3W1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms