Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx29Q9D3S3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx29Q9D3S3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms