Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3H9

5530401A14Rik, RIKEN cDNA 5530401A14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5530401A14RikQ9D3H9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
5530401A14RikQ9D3H9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
5530401A14RikQ9D3H9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms