Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef12Q9D2F1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms