Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SarnpQ9D1J3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms