Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lmbr1lQ9D1E5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms