Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm12Q9D0R8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lsm12Q9D0R8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms