Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed3Q9D0L1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zbed3Q9D0L1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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