Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e1Q9D0D5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms