Protein–RNA interactions for Protein: Q9D030

Twist2, Twist-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist2Q9D030 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist2Q9D030 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist2Q9D030 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms