Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acsl3Q9CZW4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acsl3Q9CZW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms