Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shmt2Q9CZN7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shmt2Q9CZN7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms