Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc77Q9CZH8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms