Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snf8Q9CZ28 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms