Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssu72Q9CY97 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms