Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mis12Q9CY25 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis12Q9CY25 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms