Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exo5Q9CXP9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms